个人简介
马丹，教授，博士生导师，中共党员，青年科研团队党支部书记，河北大学高层次引进人才，天津市科技专家，天津市生态环境青年科技人才，新污染物污染与管控领域青年科技人才，京津冀食品营养健康与安全创新平台青年PI，河北省生物工程学会理事，期刊Biocontaminant 和Food & Medicine Homology青年编委。研究方向专注环境微生物降解新污染物的分子机制。（1）运用多组学、生物信息学、人工智能挖掘新型关键酶，为合成生物学提供酶学元件，进一步揭示新污染物降解过程。（2）结合X射线晶体学、冷冻电镜、生物化学、计算生物学阐释新型关键酶结构与功能的关系。（3）基于原子尺度的结构信息进行新酶的设计与改造，为新污染物的生物修复提供科学基础及新的应用策略。先后主持国家自然科学基金青年项目、京津冀自然科学基金合作专项、中央军委科学技术委员会国防科技创新项目及河北省自然基金面上项目等，并作为骨干参与国家重点研发计划合成生物学重点专项、循环经济关键技术与装备专项、政府间国际科技创新合作项目等。以第一作者或通讯作者在Nature Chemical Biology, Chemical Engineering Journal, Cell Reports Methods, Journal of Integrative Plant Biology, Journal of Agricultural and Food Chemistry 等国际影响力Top期刊发表多篇SCI论文。2024年获得国际环境科学家奖最佳研究者奖（International Environmental Scientist Award，Best Researcher Award），研发的新型关键酶降解污染物被天津新闻多次报道。
培养博士3名，硕士15名。
教育经历
2013.09-2016.12 南开大学 生态学专业学习，获理学博士学位
2008.09-2011.07 天津师范大学 植物学专业学习，获理学硕士学位
2004.09-2008.07 天津商业大学生物工程专业学习，获工学学士学位
科研经历
2021.06至今 河北大学高层次引进人才，教授
2018.06-2021.03 天津大学 “Tenny丁嘉立”博士后
2016.12-2018.03/2019.2-2020.1 英属哥伦比亚大学（UBC） 博士后
讲授主要课程
本科生：生物信息学、结构生物学、蛋白质组学
研究生：结构生物学、蛋白质组学、文献阅读与论文写作（生物与医药、细胞生物学）、文献阅读与论文写作（资源利用与植物保护）、生物医药技术与研究进展、生命科学前沿研究
承担项目
1. 北京市科学技术委员会、天津市科学技术局、河北省科学技术厅，2025年度京津冀自然科学基金合作专项，合成生物制造领域，重要医药中间体CGA及其类似物的合成酶挖掘、改造及合成工艺体系构建，25JJJJC0024，2026.1-2028.12，20万元，主持，在研。
2. 京津冀（雄安新区）生态安全与生态保护教育部工程研究中心，重点项目，基于PBT类污染物暴露毒性的生物康复技术研发，2025.1-2025.12，6万元，主持，在研。
3. 河北省自然科学基金委员会，河北省自然科学基金面上项目，新型头孢氨苄降解酶的挖掘与分子改造，B2024201049，2024.01-2026.12，6万元，主持，在研。
4. 河北大学优秀青年科研创新团队，绿色生物转化创新团队，QNTD202401，2024.01-2026.12，15万元，主持，在研。
5. 天津市科学技术局，合成生物学海河实验室，合成生物突破技术创业基石项目，高效农药降解酶的开发和应用，24HHSWSS00003，2024.04-2025.03，50万元，主持，结题。
6. 河北省教育厅，河北省高等学校科学研究项目，青年基金项目，基于AI的多重耐药菌抗生素抗性基因挖掘与功能验证，QN2024104，2024.01-2026.12，5万元，主持，在研。
7. 国家自然科学基金，青年科学基金项目，PAEs高效降解菌的降解分子机理研究32101371，2022.01 - 2024.12，30万元，主持，结题。
8. 中央军委科学技术委员会，国防科技创新项目，2020.1-2020.12，60万元，主持，结题。
9. 中央军委科学技术委员会，国防科技创新项目，2018.12-2019.12，50万元，主持，结题。
10. 天津市人力资源和社会保障局，2018天津市优秀博士后国际化培养计划，冷冻电镜技术（Cryo-EM），TJBSHGJH2018004，2019.5-2020.1，10万元，主持，结题。
11. 国家重点研发计划，循环经济关键技术与装备专项，典型PBT类污染物精细化暴露评估技术与装备，子课题，典型PBT类污染物精细化暴露评估技术，SQ2023YFC3900031，2024.01-2027.12，350万元，项目骨干，在研。
12. 国家重点研发计划（政府间国际科技创新合作），基于鱼尼丁受体靶标的新型绿色农药高通量筛选关键技术研究，SQ2019YFE012106，2022.09-2025.8，300万元，项目骨干，在研。
13. 国家重点研发计划，合成生物学专项，新天然与人工产物的定向挖掘和高效合成的平台技术，子课题 ，人工产物理性设计、生物合成与功能表征的平台技术，2019YFA0905702，2020.01-2024.12，437万元，项目参与人，在研。
14. 企业项目，基于核心功能蛋白的病毒特异性纳米抗体技术开发，2020.6-2023.6，100万元，项目参与人，结题。
第一或通讯作者发表文章
1. Liyue Su; Meng Ren; Jintao Wang; Li Zhang; Sijun Dong; Dan Ma*; Jun Zhang*; Du-Qiang Luo*; Bioactivity-guided discovery of two novel hybrid polyketides with antifungal activity against phytopathogens, Pest Management Science, 2026 (IF, 3.8 /中科院一区top /JCR, Q1).
2. Dan Ma*; Xiaochen Li; Yujia Wang; Xin Zheng; Xiaofang Li*; Deep Learning Exploration Expands the Natural Diversity of Metallothioneins in the Archaea Domain, Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2025, 73, 32521−32532 (IF, 6.4 /中科院一区top /JCR, Q1).
3. Ying Pan#; Ning Wang#; DazhiLiu#; Yunyun Dong; Junheng Wang; Dan Ma*. Structural and Functional Characterization of a Novel 4,5-Dihydroxyphthalate Decarboxylase for Protocatechuic Acid Biosynthesis, Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2025, 73 (47): 30406-30416. (IF, 6.4 /中科院一区top /JCR, Q1).
4. Boxiang Kou; Yujia Wang; Yunyun Dong; Tiantian Wang; Zexun Wang; Junheng Wang; Dan Ma*; Sijun Dong*; Efficient degradation of cephalexin by newly isolated strain Brevundimonas sp. CEF1 and its biodegradation mechanisms, Chemical Engineering Journal, 2025, 522: 167124. (IF, 13.4 /中科院一区 top /JCR, Q1).
5. Dan Ma*; Yang Lyu; Yujia Wang; Xiaochen Li; Junheng Wang; Yingying Wang*; Sijun Dong*; Characterization of Two 4,5-PCD Isoenzymes Identified from Curvibacter sp. PAE-UM, Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2025, 73(32): 20004-20018. (IF, 6.4 /中科院一区top /JCR, Q1).
6. Lachlan G.Schofield; JuyiZhaoc; YuWang; Sarah J.Delforcea; Saije K.Endacotta; Eugenie R.Lumbers; Dan Ma*; Kirsty G.Pringle*; Unravelling soluble (pro)renin receptor-mediated endothelial dysfunction, European Journal of Pharmacology, 2025，996, 177601. (IF, 4.2 /JCR, Q1).
7. Rui Feng; Lili Ma; Juyi Zhao; Xiaochen Li; Sijun Dong; Yingying Wang; Yang Lyu; Ning Wang; Boxiang Kou; Yujia Wang; Yao Mu; Ying Pan; Dan Ma*; Mechanisms of efficient polyacrylamide degradation: From multi-omics analysis to structural characterization of two amidohydrolases, International Journal of Biological Macromolecules, 2024, 136329. (IF, 8.2 /中科院一区top/ JCR，Q1).
8. Rui Feng; Juyi Zhao; Xiaochen Li; Sijun Dong; Dan Ma*; Structural and Mechanistic Insights into a Novel Monooxygenase for Poly(acrylic acid) Biodegradation, International Journal of Molecular Sciences, 2024, 25(16): 8871. (IF, 5.6 /中科院二区top/ JCR, Q1).
9. Qiang He#; Dan Ma#; Wei Li; Longsheng Xing; Hongyu Zhang; Yu Wang; Cailian Du; Xuanzhao Li; Zheng Jia; Xiuxiu Li; Jianan Liu; Ze Liu; Yuqing Miao; Rui Feng; Yang Lv; Meijia Wang; Hongwei Lu; Xiaochen Li; Yao Xiao; Ruyu Wang; Hanfei Liang; Qinghong Zhou; Lijun Zhang; Chengzhi Liang; Huilong Du ; High‐quality Fagopyrum esculentum genome provides insights into the flavonoid accumulation among different tissues and self‐incompatibility, Journal of Integrative Plant Biology, 2023,65(6):1423-1441. (IF, 11.4 /中科院一区top /JCR, Q1).
10. Ruifang Ma#; Omid Haji-Ghassemi#; Dan Ma#; Heng Jiang#; Lianyun Lin; Li Yao; Arthur Samurkas; Yuxin Li; Yiwen Wang; Peng Cao; Shian Wu; Yan Zhang; Takashi Murayama; Bernard Moussian; Filip Van Petegem*; Zhiguang Yuchi*; Structural Basis for Diamide Modulation of Ryanodine Receptor, Nature Chemical Biology, 2020, 16 (11):1246-1254. (IF, 15.04/中科院一区top /JCR, Q1).
11. Yuanyuan Zhou#; Dan Ma#; Lianyun Lin,Minsheng You; Zhiguang Yuchi*; Shijun You*; Crystal structure of ryanodine receptor SPRY2 domain from the diamondback moth provides insights for development of novel insecticides, Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2020, 68 (6):1731-1740. (IF, 5.28/ 中科院一区top/ JCR, Q1).
12. Samurkas Arthur#; Fan Xiaona#; Dan Ma#; Sundarraj Rajamanikandan; Lin Lianyun; Yao Li; Ma Ruifang; Jiang Heng; Cao Peng; Gao Qingzhi; Yuchi Zhiguang*; Discovery of potential species-specific green insecticides targeting lepidopteran ryanodine receptor, Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2020, 68(15):4528-4537. (IF, 5.28/中科院一区top /JCR, Q1).
13. Jie Liu#; Dan Ma#; Lili Ma; Yuhao Song; Guanghai Gao; Yingying Wang*; Geographic distribution pattern of low and high nucleic acid content bacteria on a river-catchment scale, Marine and Freshwater Research, 2017,68:1618-1625. (IF, 2.07/中科院二区/JCR, Q2).
14. Dan Ma; Zhenyu Hao; Rui Sun; Mark Bartlam; Yingying Wang. Genome Sequence of a Typical Ultramicrobacterium, Curvibacter sp. Strain PAE-UM, Capable of Phthalate Ester Degradation[J]. Genome announcements. 2016, 4 (1):e01510-15.
专利
1. 一种头孢克肟降解菌及其应用. ZL202410421581. X已授权.
2. 一种可降解头孢氨苄的泡状短波单胞菌及其应用. ZL202410422131.2已授权.
3. 一种可降解头孢氨苄的贪噬菌及其应用. ZL202410421158.X已授权.
指导学生获奖
2024年、2025年“晨光行动——石药奖学金”
2025年国家奖学金
河北省大学生创新训练计划——“酶”你不行-AI赋能的青霉素酰化酶挖掘及工程菌改造
河北省2025年研究生创新能力培养资助项目——基于计算机辅助设计改造还原胺化酶精准构筑JNT-517中间体
河北省2023年研究生创新能力培养资助项目——聚丙烯酰胺高效降解菌的降解分子机理研究
《A novel amidohydrolase catalyze the degradation of polyacrylamide by Klebsiella sp.PCX》荣获2023 年第六届应用生物技术国际会议优秀墙报奖
获奖
2025河北大学研究生教学成果奖校级二等奖—党建赋能高层次生物专业科研人才培养新模式探索与实践
2025 河北大学生命科学学院优秀共产党员
2025 河北大学先进基层党组织
2025 河北大学生命科学学院先进基层党组织
